Die Handhabung von Aushubmaterial ist eine wichtige Methode bei Mikrotunnelbau- und Rohrvortriebsprojekten. Bei Projekten mit kleinem Durchmesser wird das Aushubmaterial oder der Schlamm aus dem Aushubgesicht durch eine Rohrleitung zur Oberfläche transportiert oder kann einfach durch einen rotierenden Bohrer zurück zum Startschacht entfernt werden. Bei größeren Tunneln können Förderbandsysteme oder Schienenfahrzeuge für den Aushub verwendet werden. Die Aushub- und Abtransportsysteme können die Fähigkeit haben, mit Felsbrocken bis zu einem bestimmten Durchmesser umzugehen, indem sie diese Felsbrocken vor dem Eintritt in den Rest des Abtransportsystems zerkleinern. Wenn Felsbrocken etwa ein Drittel des Durchmessers des Mikrotunnels überschreiten, können sie weder in die Zerkleinerungskammer für ein Schlamm-System gelangen noch durch den Bohrer in einem Bohrsystem passieren.
Schlammsysteme mischen den ausgegrabenen Boden und Felsen zu einer Schlammsuspension, die zur Oberfläche gepumpt wird. Für solche Systeme muss das ausgegrabene Material dann mithilfe von Schüttlern und Hydrozyklonen von der Schlammsuspension getrennt werden, bevor es entsorgt werden kann.